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GDSC database Revie..

Genomics of Drug Sensitivity in Cancer The Genomics of Drug Sensitivity in Cancer project is an academic research program to identify molecular features of cancers that predict response to anti-cancer drugs. Figure 1. 3 Main datas Please be aware that our website and results are part of an ongoing project. These webpages are updated frequently a..

Major Study./Bioinformatics 2016.05.02
Survival analysis - Lo..

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 1. 파일의 구조 및 데이터 정보 2. 생존과 관련된 환자정보 3. LogRank test로 위의 두 그룹이 유의하게 생존에서 차이를 보이는지 확인하기 4. Cox-proprtional harzard regression analysis: 회귀를 이용한 생존분석 Log rank test 독립변수를 통해 group화 된 샘플이, 그룹간에 생존분포 차이가 있는지 확인할 수 있는 가설검정 (h..

Major Study./Bioinformatics 2015.08.12
RNASeq normalization..

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 일반적으로 RNA-seq data는 DEG분석 (Differential expression analysis)를 하기에 앞서 정규화(normalization) 된다. RNASeq normalization은 다음의 이유로 사용된다. - 샘플간의 비교 - 유전자(Gene)의 비교 - 통계 모델을 RNASeq 데이터에 대해 사용하기 위해 RPKM:Reads (Fragments) Per Kilobase per Million(mappe..

Major Study./Bioinformatics 2015.05.18
다중회귀 LASSO regre..

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 이 글은 제가 공부하며 썼던 내용이라, 지금 보니 너무 허접해서 새롭게 포스팅해봤습니다. Ridge, Lasso regularization을 공부하고 싶으신 분은 아래 링크를 보시길 추천드립니다. http://sosal.kr/1104 --------------------------------------------------------- 연구나 실험 등, 다양한 분야에 걸쳐서 '모형의 단순화'는 매우..

Programing/R- programming 2015.04.25

Sankey & Transition plot

Programing/R- programming sosal sosal 2019.04.24 0 comment
Lasso, Ridge regularization - 회귀..

Programing/R- programming sosal sosal 2019.01.18 0 comment
R system command 127 에러

Programing/R- programming sosal sosal 2018.10.23 0 comment
R venn diagram 'venn' package

Programing/R- programming sosal sosal 2018.07.10 0 comment
R deep learning with Keras

Programing/R- programming sosal sosal 2018.06.20 0 comment
R Shiny, 웹 기반의 Real time Visual..

Programing/R- programming sosal sosal 2018.03.23 0 comment

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