Radiology image를 TCIA에서 항상 다운받는데, 항상 그때마다 token이 만료돼서 매번 찾아보게된다.
또 까먹고 당황하다가, 이번엔 꼭 정리해서 다음에 또 시간을 낭비하지 않기 위해 기록하기로 함.
1. TCIA 데이터를 찾아, .TCIA 파일을 다운받는다.
예를 들면 CBIS-DDSM 같은.. Mammography 이미지 데이터셋
https://www.cancerimagingarchive.net/collection/cbis-ddsm/
근데 다운로드를 누르면 진짜 이미지를 바로 받는건 아니고, .tcia 포맷의 파일이 다운받아진다.
예를 들면 이렇게: CBIS-DDSM-All-doiJNLP-zzWs5zfZ.tcia
2. NBIA Data Retriever 를 설치한다.
https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/NBIA/8.1+Downloading+the+NBIA+Data+Retriever
나는 리눅스에 다운받는 환경이지만, 윈도우 유저의 경우 여기서 윈도우를 쓰면 됨.
아래의 경로로 설치됨
/opt/nbia-data-retriever/nbia-data-retriever
3. 계정을 생성한다. ID, PW를 기억한다.
https://www.cancerimagingarchive.net/pwm/public/NewUser
이상하게 login, ID 생성 페이지가 잘 안보이는데, 위 페이지로 접속하면 됨.
4. crential.txt 파일을 생성한다. 내용은 아래와 같이:
userName=아이디
passWord=패스워드
5. 리눅스 커맨드에서 다음을 실행한다.
nbia-data-retriever \
--cli TCIA파일
-d 다운로드장소
-l credential.txt
ex:
/opt/nbia-data-retriever/nbia-data-retriever --cli /path/CBIS-DDSM-All-doiJNLP-zzWs5zfZ.tcia -d /mnt/e/CancerImagingArchive/CBIS_DDSM -l /mnt/e/CancerImagingArchive/credential.txt -v –f
잘 다운받아지는중 ㅎㅎ
다운받아진 결과파일
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