전체 글 759

BLAST 리눅스 서버 command에서 실행하기

0. Input으로 사용할 Sequence data 준비. ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/H_sapiens/mRNA_Prot/에서 아무거나... faa 확장자 파일 준비.모든 파일들을 하나로 합쳐서 sequences.faa 라는 파일로 완성.. # head sequences.faa 1. BLAST Linux executable 파일 다운로드URL: ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ NCBI에서, 소프트웨어 다운로드란에 들어가서 BLAST를 다운받는다. 2. wget으로 위의 blast x64-linux.tar.gz파일 다운로드. wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/exe..

MRI weighting - T1 vs T2 비교

MRI: Magnetic Resonance Imaging. 자기공명영상 MRI는 신경학 및 신경외과에서 가장 일반적으로 사용되는 검사.뇌, 척수 및 혈관 해부학에 대한 세부 사항을 제공하며, 해부학을 시각화 할 수 있다는 이점이 있음. 가로면, 관상면, 시상면 (영문으로는 각 Axial, coronal, sagittal 으로 표현) 으로 해부학을 보여주며,절편 두께는 1~10 mm로 다양하다. 특히 MRI는 관상, 시상 (Coronal, Sagittal) 영상에 특히 좋다.가로면 (Axial) 영상은 CT가 우월하다고 한다. (그래서 MRI를 CT로 변환하는 논문들의 figure들은 주로 Axial을 나타낼까...? ) MRI Basic은 http://casemed.case.edu/clerkships/n..

MATLAB online, 웹에서 matlab 코딩하기

매트랩은 무겁고, 용량도 커서 내 노트북에 설치하고 다니기가 힘들었다.모듈들 이것저것 받다보면 엄청나게 뿔어나는 용량.. 매트랩 초보자라 몰랐던것 같기도 한데, 온라인 버전으로 코딩하는 서비스가 있었다. https://matlab.mathworks.com/ MATLAB 라이센스만 있으면 바로 이용가능하다.분석하고자 하는 데이터, 혹은 이미지 업로드도 가능하다. Cloud Storage and Synchronization Full integration with MATLAB Drive gives you 5GB to store, access, and manage your files from anywhere with MATLAB Online. Use MATLAB Drive Connector to sync you..

python scipy - ImportError: DLL load failed

진짜 scipy 안에 있는 모듈을 import 할 때, DLL이 없다고 에러가 난다. 구글링 해서 Stack-overflow 같은 곳에서는 NumPy+MKL 를 설치하라고 난리다.해당 파일은 http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/ 에서 다운받아서 설치할 수 있지만,본인은 아무리 Numpy, scipy를 지우고 NumPy+MKL을 따로 받아 설치하고 해도scipy는 import 되는데, 안에있는 sub-module에 대해서는 DLL error가 발생했다. >>> import scipy# scipy는 잘 import 됨. >>> import scipy.miscTraceback (most recent call last): File "", line 1, in File "C:..

python DICOM (DCM) 이미지를 png, jpg로 바꾸기

DICOM 이미지를 이용해서 학습을 하려고, jpg나 png format으로 바꾸려고 했는데,예전에 어떤 library를 썼는지 잘 기억이 안나서.. 구글링해보니 mritopng 라는 정말 간단한 패키지가 있어서, 혹시 까먹을까봐 포스팅으로 남겨본다. https://github.com/danishm/mritopng 위 github에서 zip 파일 다운받아서 압축을 풀고,콘솔에서 python setup.py install 하나로 설치 완료. 혹은 pip install mritopng convert_file이란 함수로 파일 이름 하나하나 짚어가면서 바꿀 수 있고,convert_folder 함수로 폴더 안에있는 모든 dicom 파일을 (DCM) png로 바꿀 수 있다. import mritopng # Conv..

Tensorflow-gpu No module named '_pywrap_tensorflow' 에러

return _bootstrap._gcd_import(name[level:], package, level) File "", line 986, in _gcd_import File "", line 969, in _find_and_load File "", line 958, in _find_and_load_unlocked File "", line 666, in _load_unlocked File "", line 577, in module_from_spec File "", line 906, in create_module File "", line 222, in _call_with_frames_removed ImportError: DLL load failed: Impossibile trovare il modulo s..

Windows10 / ubuntu bash 아파치 서버 설치

httpd, Apache 서버를 설치하기 위해 보통 리눅스 서버를 준비했었다.윈도우에서 서비스형태로 설치하는 Apache, php, mysql 같은건 관리하기가 너무 구려서(?).. 윈도우10 ubuntu bash를 이용하면 apt-get으로 아주 쉽게 설치가 가능하다. sudo apt-get install apache2sudo service apache2 startsudo service apache2 status 3줄로 apache2가 동작하고 있는지 확인 완료.. 크롬으로 localhost에서 apache가 돌아가고 있는지 확인 완료.. 넘나 간단하다 ㅋㅋ. php, mysql 등, 다른 웹 관련 툴과 모듈을 설치해주려면 아래정도.. 가 도움이 될 것 같다. sudo apt-get install ph..

The elements of style - 글쓰기의 요소

간결하고 명확하게 영어를 쓰는 힘. 지적 문장을 위한 영어의 18원칙이라는 소제목을 가진 책이다. 연구실 박사님에게 논문 Writing, 영작을 잘하려면 어떻게 해야해요? 라고 물었을 때,'The element of style' 을 추천해주셨다. 코넬대 영문과 교수 (윌리엄 스트렁크 Jr.) 가 46년간 재직하며 보았던 글쓰기의 문제점들을 정리하여약 60페이지의 짧은 책을 써냈고, 이 책은 대학 신입생들의 필독서가 되었다. 이 책에서 강조하는 바로는 바로 간결함이다.내가 존경하는 지도교수님도, 직접 writing을 지도받아보진 못했지만항상 짧고 힘있는 문장들을 구사하신다는 말을 선배님들로부터 많이 전해들었다. '불필요한 단어는 삭제할수록 좋다'는 그의 주장은 '모든 단어가 말을 하게 하라'는 표현으로 응..

카테고리 없음 2017.08.06

신촌 성악레슨, 뮤지컬 개인레슨

테너 김홍제 명지대학교 성악과 독일 프라이부르크 국립음대 명지대학교 대학원 영화 뮤지컬과 각종 오페라에 주조역으로 활동 뮤지컬 부스코러스 및 조연출 음악 조연출 활동 안산 예전교회 대예배 지휘자 한국미래사회복지재단 문화이사 및 합창단 지휘자 카르페디움 음악 아카데미 대표 예원예술대학교 평생 교육원 강사 (기타 활동 등) 음악 아카데미 관련하여 오랫동안 활동해오셨습니다. 제 레슨 선생님이신데, 선생님 참 많이 바꿔가면서 레슨 받아왔는데 그 중, 최고의 선생님이십니다 ㅎㅎ. 레슨 퀄리티에 대해서는 걱정하지 않으셔도 됩니다. 정말루! 레슨위치는 신촌 연세대학교 옆 리움 스튜디오입니다. 레슨 상담은 1회 레슨으로, 무료로 진행됩니다. 성악, 뮤지컬, 교회음악, 합창발성 등 전화상담 문의: 010-3819-079..