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/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 전이(Metastasis)의 위키피디아 정의는 다음과 같다. 전이 - Metastasis 암세포 따위가 옮겨다니는 일이다. 전이 능력이 없는 종양을 양성 종양이라고 하여 전이 능력의 존재 여부는 암과 양성 종양을 구분하는 기준이 된다. https://ko.wikipedia.org/wiki/%EC%A0%84%EC%9D%B4_(%EC%9D%98%ED%95%99) primary tumor은 실제로 암이 발생한 위치의 종양을 말한다. 사전상으로 한국어로 '원발성 종양' 로 불리는 것 같다. 암에 의한 죽음은 대부분 Primary tumor보다 metastasis가 사망의 주요한 원인이 된다. (약 90%) 전이는 Primary tumor..

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ Fasting cycles retard growth of tumors and sensitize a range of cancer cell types to chemotherapy 라는 제목의 논문으로, Longo 지도교수의 유명한 논문이다. Lee, Changhan, et al. "Fasting cycles retard growth of tumors and sensitize a range of cancer cell types to chemotherapy." Science translational medicine 4.124 (2012): 124ra27-124ra27. 이 논문은 Science translational medicine 에..

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ GWAS Catalog 데이터를 보고있던 중, 어떤 강의자료를 만들면서 Obesity와 association이 있는 variant를 찾아보고자 하였다. Gene 단위로, 어떤 유전자가 Obesity와 연관성이 있느냐, 유전자를 count 하던 와중 하나의 GWAS loci variant(rsID)에서 2개의 유전자가 annotation이 되는 경우가 있었다. DISEASE.TRAIT MAPPED_GENE SNPS 1749 Obesity (extreme) OXNAD1, RFTN1 rs12635698 OXNAD1, RFTN1 각기 다른 유전자가 어떻게 동일한 rsID에 annotation이 될 수 있을까? 고민하다가 유전자의 over..

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 멜론을 오래 써왔는데, 다운받은 곡이 하도 많고 신곡은 잘 안듣는 터라 멜론서비스를 더이상 이용하지 않고, mp3 플레이어로 갈아타게 됐습니다. (서비스 끊으려니 할인해준다고 하네요.. 뭔가 기분이 나쁜 ;;) 곰 오디오 다운로드: http://gom2.gomtv.com/release/gom_audio.htm 기본 곰오디오 스킨은 다음과 같습니다. 스킨이 좀 심심하죠? 원하는 스킨으로 바꾸도록 해봅시다. 1. 간편 스킨 바꾸기 우클릭 -> 스킨 -> 간편스킨 그러면 간편스킨 창이 뜹니다. 원하는 스킨, 테마를 검색하시거나 둘러보셔서 마음에 드시는게 있으시면 가운데 스킨 이미지에 마우스를 올리고 스킨 다운로드 클릭만 해주시면 됩니다..

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 맨날 전공지식만 올리다가, 정말 오랜만에 맛집 포스팅을 하게됐네요.. 친구가 구로디지털단지 (구디? 구디단? 으로 줄여부르더라구요.)에 살아서 놀러갔더니 발꾸락이란 음식점을 추천해줬어요. 사장님 사진이 엄청 크게 걸려있는걸로 봐서 음식에 대한 자부심이 대단하신 것 같네요 ㅋㅋ. 정말 음식 맛도 끝내줬습니다~! 아쉽지만, 친구랑 둘이서 늦은 저녁 식사겸 술한잔 하느라 온거라 많은 음식을 찍진 못했어요. 메뉴판입니다. 메인메뉴 / 일품요리 따로 나눠져있었는데 두명이서 먹는거라 메인메뉴는 좀 많을 것 같아서, 양념보삼에 꽃게수제비탕으로 주문했어요. 세트메뉴도 있고, 식사메뉴도 있습니다. 다른 맛집 포스팅 글에 보면 식사류도 점심이나 저..

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ - 명동 로얄호텔 위치, 찾아가는 길 명동역 8번출구에서 명동대성당으로 쭉 올라오거나, 을지로입구역 5, 6 출구에서 명동대성당 방향으로 올라오는 길에 있는 호텔입니다. 1971년 3월에 최초 개장했다는데, 그럼 벌써 45년이 넘게 흘렀네요. 오래된 호텔 답게, 이름도 '로얄' (royal) 입니다. 옛날엔 이런 이름이 정말 고급져보였죠. 이 호텔에서 결혼식을 올린다는 건, '서울 시내의 유명한 집안의 자제라는걸 증명하는 것이다' 라고 말씀하시는 분도 계셨습니다. 아무튼, 명동역에 위치한 오래된 고급호텔인 '로얄호텔' (Royal hotel) 에서 저녁식사를 하게 됐습니다. 정보의학포럼 조교로 참가하면서 힘든 강의 끝에 엄청 고급..

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 카메라 테스트겸, 저녁먹고 오는길에 이래저래 사진좀 찍어봤습니다. 서울대의대 연건캠퍼스의 교육관에서 기초연구동을 바라보고 찍어봤습니다. 이건 기초동 아래에서 위로 찍어봤습니다. 노후된 건물과, 상단의 '서울대학교 의과대학; 간판이 인상적입니다. 이건 기초동 앞에서 블랙머그 커피숍을 바라보고 찍어봤습니다. 신축중인 건물... 건물이름도 모르고 있네요. 신축건물 앞쪽 쉼터(?), 공원(?) 쪽에 이상한 물 웅덩이를 만들어 놨네요

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ Park, Sunho, et al. "An integrative somatic mutation analysis to identify pathways linked with survival outcomes across 19 cancer types." Bioinformatics 32.11 (2016): 1643-1651. Bioinformatics 저널에 나온 figure 3번 결과를 보면서, Log-Rank p-value가 유의하게 나온 것을 보면서 이렇게 그룹이 많은데 log-rank test는 당연히 유의하게 나오는 것이 아닐까? 라는 생각을 해봤다. 이 그래프에 대한 설명은 다음과 같다. Cancer-type-specific a..

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 다음 지도 API키 발급받기 다음에 로그인을 한 후, 아래 사이트에 접속한다. http://apis.map.daum.net/web/guide/ 왼쪽 탭 아랫쪽에, 키발급 버튼을 누르시면 콘솔 관련 웹사이트로 이동하게 됩니다. 여기서 앱 만들기 버튼을 누르시고 앱을 생성하시면 됩니다. 저는 단순히 practice라는 이름으로 앱을 만들었고, 화면에서 앱 이름과 앱 ID, 앱 URL 등을 확인할 수 있습니다. 화면 아랫쪽엔 REST/JS API에서 + 버튼을 누르시면 실제 API_Key를 받아볼 수 있습니다. 저는 sosal.kr 웹페이지에서 API를 테스트 해볼 예정이기 때문에, sosal.kr를 Referer에 넣어주었습니다. 완..

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ R 설치할 때, 다른 package에 dependency가 있을 경우 혼란스러운 경우가 많다. RcppArmadillo 패키지를 설치하려는데 에러가 발생했다.ERROR 메시지에는 Configuration failed가 뜨는데 딱히 도움이 되는 에러가 아니다. WARNING을 찾아보니, G++가 4.6버전보다 높아야 한다고 한다. [sosal@piano GEODATA]$ R CMD INSTALL RcppArmadillo_0.7.100.3.1.tar.gz * installing to library '/storage/home/sosal/programs/R/R-devel/library' * installing *source* packag..