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MDS (Multi dimensional scaling)와 PCA 알고리즘

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ MDS - Multi dimensional scaling PCA - principal component analysis MDS - Multi dimensional scaling 데이터 분석 관련 서적들에서는 '다차원척도법'으로 직역하는 것 같다. MDS 기법은 numeric 변수로만 이루어 졌을 때 사용이 가능하다. 자료들의 '비유사성' 거리를 바탕으로, 다중의 변수들을 2차원 혹은 3차원으로 낮추어 나타내는 기법이다. 낮은 차원에서의 자료들이 거리가 멀리 떨어져 위치한다는 것은 비유사성이 높다는 뜻이고, 자료가 가까울수록 비유사성이 낮다 (즉 유사성이 높다)는 뜻이 된다. MDS를 이용하여 데이터를 시각화 하는 방법의 가장 큰 ..

VirtualBox 리눅스 SSH 포트포워딩 하는법

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ VirtualBox 에서 리눅스를 설치하셨을 겁니다. 일단 ssh로 리눅스 서버에 접속하기 위해서, ssh demon이 필요합니다. (sshd) 먼저 sshd를 설치해줍시다. - Ubuntu sudo apt-get install openssh-server - CentOS yum -y install openssh-server openssh-clients netstat -ntl 같은 명령어로 22번 포트가 열려있는지 확인해주시고.. ifconfig로 네트워크가 잘 동작하고 있는지도 확인해줍니다. VirtualBox 설치 시, Network 설정을 default로 해주셨다면 일단 기본적으로 이더넷 카드의 address는 10.0.2.1..

윈도우10 1주년 업데이트 하는법

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 윈도우10, 1주년 업데이트가 떴습니다. 업데이트 규모가 커서 그런지, 자동으로 업데이트는 안되고 따로 받아주셔야 업데이트가 되네요. 윈도우10 인터페이스가 워낙 좋아서, 이번 업데이트는 저는 바로 하기로 결심했습니다. 1. 시작키를 누른 후에, update를 검색해주시면 제어판 메뉴 중 하나인, '업데이트 확인' 이 뜹니다. 이걸 클릭해주세요. Windows 업데이트 화면이 뜹니다. 여기서 '자세한 정보'를 눌러주시면 됩니다. 제가 그림에 따로 표시를 안했지만, '자세한 정보' 를 누르시면 됩니다. 그러면 이렇게 'Windows 10 업데이트 기록' 화면이 브라우저로 뜨게 됩니다. '1주년 업데이트 다운로드' 를 눌러주시면 업데..

오리온 초코파이 - 바나나맛 [情]

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 오리온 초코파이 바나나맛 (12개입)을 매점에서 4100원에 들고왔습니다. 정가는 잘 모르겠네요. 초콜릿 가공품 (코코아원료 2.5%) 444g (2,076 kcal) 바나나퓨레 1.1% 바나나플레이크 0.7% (바나나원물환산 4.2%) 2076 칼로리니까, 개당 173 칼로리네요. 생각보다 그렇게 높진 않은데요? ㅋㅋ 솔직히 포장지가 너무 맛있게 생겨서.. 그냥 초코파이 사려다가 바나나맛을 집었습니다. 노랑노랑 한게.. 뭔가 먹음직스러워 보입니다. 일단 겉보기는 똑같아요. 똥글똥글한게.. 그냥 비슷한 초코파이? 한입 물었는데 약간 얍실한 바나나맛(?) 이 납니다 ㅋㅋ. 진짜 바나나랑은 좀 다르고.. 우주선 바나나우유 맛에 약간 ..

Stigmatized./Outing 2016.08.10

EMT - 상피간엽이행 (Epithelial to Mesenchymal Transition)

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 전이(Metastasis)의 위키피디아 정의는 다음과 같다. 전이 - Metastasis 암세포 따위가 옮겨다니는 일이다. 전이 능력이 없는 종양을 양성 종양이라고 하여 전이 능력의 존재 여부는 암과 양성 종양을 구분하는 기준이 된다. https://ko.wikipedia.org/wiki/%EC%A0%84%EC%9D%B4_(%EC%9D%98%ED%95%99) primary tumor은 실제로 암이 발생한 위치의 종양을 말한다. 사전상으로 한국어로 '원발성 종양' 로 불리는 것 같다. 암에 의한 죽음은 대부분 Primary tumor보다 metastasis가 사망의 주요한 원인이 된다. (약 90%) 전이는 Primary tumor..

단식, 금식은 면역체계를 활성화 하며, 항암치료 반응을 높인다.

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ Fasting cycles retard growth of tumors and sensitize a range of cancer cell types to chemotherapy 라는 제목의 논문으로, Longo 지도교수의 유명한 논문이다. Lee, Changhan, et al. "Fasting cycles retard growth of tumors and sensitize a range of cancer cell types to chemotherapy." Science translational medicine 4.124 (2012): 124ra27-124ra27. 이 논문은 Science translational medicine 에..

Stigmatized./Essay 2016.08.04

하나의 variant rsID에 여러 유전자가 annotation

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ GWAS Catalog 데이터를 보고있던 중, 어떤 강의자료를 만들면서 Obesity와 association이 있는 variant를 찾아보고자 하였다. Gene 단위로, 어떤 유전자가 Obesity와 연관성이 있느냐, 유전자를 count 하던 와중 하나의 GWAS loci variant(rsID)에서 2개의 유전자가 annotation이 되는 경우가 있었다. DISEASE.TRAIT MAPPED_GENE SNPS 1749 Obesity (extreme) OXNAD1, RFTN1 rs12635698 OXNAD1, RFTN1 각기 다른 유전자가 어떻게 동일한 rsID에 annotation이 될 수 있을까? 고민하다가 유전자의 over..

곰오디오 스킨 바꾸기 / 적용하기

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 멜론을 오래 써왔는데, 다운받은 곡이 하도 많고 신곡은 잘 안듣는 터라 멜론서비스를 더이상 이용하지 않고, mp3 플레이어로 갈아타게 됐습니다. (서비스 끊으려니 할인해준다고 하네요.. 뭔가 기분이 나쁜 ;;) 곰 오디오 다운로드: http://gom2.gomtv.com/release/gom_audio.htm 기본 곰오디오 스킨은 다음과 같습니다. 스킨이 좀 심심하죠? 원하는 스킨으로 바꾸도록 해봅시다. 1. 간편 스킨 바꾸기 우클릭 -> 스킨 -> 간편스킨 그러면 간편스킨 창이 뜹니다. 원하는 스킨, 테마를 검색하시거나 둘러보셔서 마음에 드시는게 있으시면 가운데 스킨 이미지에 마우스를 올리고 스킨 다운로드 클릭만 해주시면 됩니다..

Stigmatized./ETC. 2016.08.01

구디 족발 끝내주는 회식 맛집 추천 - 발꾸락

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 맨날 전공지식만 올리다가, 정말 오랜만에 맛집 포스팅을 하게됐네요.. 친구가 구로디지털단지 (구디? 구디단? 으로 줄여부르더라구요.)에 살아서 놀러갔더니 발꾸락이란 음식점을 추천해줬어요. 사장님 사진이 엄청 크게 걸려있는걸로 봐서 음식에 대한 자부심이 대단하신 것 같네요 ㅋㅋ. 정말 음식 맛도 끝내줬습니다~! 아쉽지만, 친구랑 둘이서 늦은 저녁 식사겸 술한잔 하느라 온거라 많은 음식을 찍진 못했어요. 메뉴판입니다. 메인메뉴 / 일품요리 따로 나눠져있었는데 두명이서 먹는거라 메인메뉴는 좀 많을 것 같아서, 양념보삼에 꽃게수제비탕으로 주문했어요. 세트메뉴도 있고, 식사메뉴도 있습니다. 다른 맛집 포스팅 글에 보면 식사류도 점심이나 저..

Stigmatized./Outing 2016.07.30

명동 로얄호텔 (Royal hotel) 저녁식사 한우스테이크

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ - 명동 로얄호텔 위치, 찾아가는 길 명동역 8번출구에서 명동대성당으로 쭉 올라오거나, 을지로입구역 5, 6 출구에서 명동대성당 방향으로 올라오는 길에 있는 호텔입니다. 1971년 3월에 최초 개장했다는데, 그럼 벌써 45년이 넘게 흘렀네요. 오래된 호텔 답게, 이름도 '로얄' (royal) 입니다. 옛날엔 이런 이름이 정말 고급져보였죠. 이 호텔에서 결혼식을 올린다는 건, '서울 시내의 유명한 집안의 자제라는걸 증명하는 것이다' 라고 말씀하시는 분도 계셨습니다. 아무튼, 명동역에 위치한 오래된 고급호텔인 '로얄호텔' (Royal hotel) 에서 저녁식사를 하게 됐습니다. 정보의학포럼 조교로 참가하면서 힘든 강의 끝에 엄청 고급..

Stigmatized./Outing 2016.07.25
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