Major Study./Bioinformatics 73

DNA 서열 alignment를 통한 가계도 분석

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ Bioinformatics. 생물정보학 수업을 들으면서 가장 재미있었던 sequence alignment 관련 내용입니다. 1. Global alignment vs Local alignment 서열분석의 목적은 관심 있는 서열의 유사점과 차이점을 분석하여 염기와 아미노산 수준에서 서열간의 구조적 기능적 및 진화론적 관련성을 추론하려는 것입니다. Figure 1.1 Dynamic programming(DP) : 두 개의 염기서열에 대해서 정렬하기 위해 사용되는 알고리즘. 이러한 방법은 두 개의 서열 사이에서 Optimal aliment를 구해줍니다. Optimal alignment는 두 개의 sequence에 대해서 matched,..

Bioinformatics - DNA 유전자정보 획득 (shotgun)

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ Central dogma: 유전정보는 DNA상의 염기배열에서 상보적 염기배열을 가지는 mRNA로 옮겨져, 다시 ribosome위에서 단백질의 아미노산 배열로 전달된다는 한 방향의 흐름이 있음. Crick는 이 유전정보 전달의 흐름을 생물의 일반적 원칙으로서 central dogma 라 부르게 함. /Naver 지식사전 1) Shotgun: DNA 서열분석 방법 중 하나 분석하려는 대상이 되는 유전체를 여러 개 준비하여 각각에 대해 무작위 적으로 2,000 bp, 10,000 bp크기만큼 잘라, 그 서열들을 plasmid에 삽입하여 clone library를 만든 후, 모든 부분 서열에 대해 양쪽으로 500bp 만큼 해독하여 데이터..

Bioinformatics 개론, 기본 개념 정리

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ * Bioinformatics의 정의 Bio – 생물학 Informatics – 전산학 Bioinformatics – 전산학, 통계학적인 기술들을 이용하여 생물학에서 발생하는 문제들을 해결하는 분야 * 이번 포스트에서 다룰 단어들 1. Chromosomes 염색체 2. DNA - deoxyribonucleic acid 3. Gene and genome 4. RNA 5. Synthesis of protein 단백질합성 6. Exon , intron 7. Codon / RNA 암호 기본단위 1. Chromosomes - 염색체 위에 있는 그림은 세포막 속의 여러 개의 소 기관들을 나타냅니다. Nucleus : 핵. 핵속에 Chromo..