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/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ Bioinformatics. 단일염기 다형성 (SNP) 의 정의? SNP(Single Nucleotide Polymorphism): 단일 염기 다형성. DNA sequence에서 각 염기에 나타나는 일반적인 돌연변이로, 유전체에서 인종, 개인차, 질병 등을 가져오게 되는 부분입니다. DNA 염기순서가 개체 사이에서 500 ~ 1,000개 염기 당 1개 정도 나타나며, 이런 미세한 차이에 의해 유전자의 기능이 달라질 수 있습니다. 이런 것들이 유전적인 개인차를 알아내는 유력한 단서가 되며, 인간의 개놈에는 약 300만개의 SNP가 존재한다고 합니다. RFLP(Restriction fragment length polymorphism)..

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ KAIST 바이오 뇌공학과에서 주최한 제 1회 전국 대학생 바이오 컴퓨팅 대회 본선에서 우수상을 수상했습니다.

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ Using codon (3 nucleic acid of DNA), it returns 1 Amino acids. DNA 염기서열을 이용하여 최종 만들어질 Protein을 구하는 프로그램을 만들 때 구현해봤던 함수입니다. parameter is string which consists of 3 char of base.ex). AGC, TAT... 파라미터로 들어오는 input은 3개의 문자열입니다.예) AGC, TAT char translation(string input){ char RET; switch(input[0]){ case 'A': switch(input[1]){ case 'A'://AA switch(input[2]){ ca..

제 1회 전국 대학생 Biocomputing 경진대회분류 생물학관련 모든 분야주관 한국생물정보시스템생물학회 (KSBSB)날짜 2011.10.01장소 KAIST 정문술 빌딩교육비 무료문의처seokjongyu@gmail.comURL http://biosoft.kisti.re.kr/bcc2011첨부파일 1 BCC2011_Poster.jpg (626.12 KB)경진대회 목적생물정보분석에대한 공지된 문제를 관련 소프트웨어를 활용하여 해결함으로써 융합연구에 대한 인식을 재고하며, 대학생들의 성취의욕 고취하고자 함.경진대회 내용주어진 바이오.의료.헬스 분야의 컴퓨팅 문제해결 예선: 문제해결 제안서 평가를 통해 본선 진출팀 결정 본선: 자신이 개발한 방법을 사용하여 대회 당일 경진대회일정경진대회 문제 공지 : 2011..

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ Bioinformatics. 생물정보학 수업을 들으면서 가장 재미있었던 sequence alignment 관련 내용입니다. 1. Global alignment vs Local alignment 서열분석의 목적은 관심 있는 서열의 유사점과 차이점을 분석하여 염기와 아미노산 수준에서 서열간의 구조적 기능적 및 진화론적 관련성을 추론하려는 것입니다. Figure 1.1 Dynamic programming(DP) : 두 개의 염기서열에 대해서 정렬하기 위해 사용되는 알고리즘. 이러한 방법은 두 개의 서열 사이에서 Optimal aliment를 구해줍니다. Optimal alignment는 두 개의 sequence에 대해서 matched,..

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ Central dogma: 유전정보는 DNA상의 염기배열에서 상보적 염기배열을 가지는 mRNA로 옮겨져, 다시 ribosome위에서 단백질의 아미노산 배열로 전달된다는 한 방향의 흐름이 있음. Crick는 이 유전정보 전달의 흐름을 생물의 일반적 원칙으로서 central dogma 라 부르게 함. /Naver 지식사전 1) Shotgun: DNA 서열분석 방법 중 하나 분석하려는 대상이 되는 유전체를 여러 개 준비하여 각각에 대해 무작위 적으로 2,000 bp, 10,000 bp크기만큼 잘라, 그 서열들을 plasmid에 삽입하여 clone library를 만든 후, 모든 부분 서열에 대해 양쪽으로 500bp 만큼 해독하여 데이터..

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ * Bioinformatics의 정의 Bio – 생물학 Informatics – 전산학 Bioinformatics – 전산학, 통계학적인 기술들을 이용하여 생물학에서 발생하는 문제들을 해결하는 분야 * 이번 포스트에서 다룰 단어들 1. Chromosomes 염색체 2. DNA - deoxyribonucleic acid 3. Gene and genome 4. RNA 5. Synthesis of protein 단백질합성 6. Exon , intron 7. Codon / RNA 암호 기본단위 1. Chromosomes - 염색체 위에 있는 그림은 세포막 속의 여러 개의 소 기관들을 나타냅니다. Nucleus : 핵. 핵속에 Chromo..