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/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 윈도우 Putty ssh 클라이언트를 이용해서 리눅스에서 서버작업을 하고있다. 특히 R에서 graph를 그릴 때, 파일로 저장해서 그리곤 했는데, 별로 불편함을 못느껴서 파일로 저장하고 winSCP 같은 SFTP로 그림파일을 하나하나 다운받아서 확인해보고 했었다. 최근에 멍청한 방법이란걸 깨닫고 X11 포워딩을 검색하였더니 쉽게 해결방법을 찾을 수 있었다. 아래의 포스팅에서 대부분 가져온 내용입니다. http://ts.devbj.com/138 putty는 좀 불편해서 투명푸티로 유명한 iputty를 사용하고 있었는데, putty나 iputty나 모두 적용 가능한 방법이다. 사용하고 있는 Putty (혹은 iPutty)에서 x11 ..

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ Cancer와 관련된 공개서열 데이터에서 가장 유명한 TCGA (The Cancer Genome Atlas)에서는 Somatic mutation data를 특정한 포맷으로 제공한다. - LINK https://wiki.nci.nih.gov/display/TCGA/Mutation+Annotation+Format MAF (Mutation Annotation Format) 파일로서 제공된다. TCGA data portal에서 직접 검색하여 받을 수 있지만, MAF 파일은 https://wiki.nci.nih.gov/display/TCGA/TCGA+MAF+Files 에서 매우 쉽게 파일의 정보들과 데이터 파일의 링크를 찾아볼 수 있다. ..

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 암의 생물학 - The biology of CANCER Robert A. Weinberg 컴퓨터공학 전공자로서, 생물정보학(Bioinformatics)를 전공하면서 생물에 관한 부족한 부분들을 채워줄 수 있는 좋은 책이었습니다. http://www.kyobobook.co.kr/product/detailViewKor.laf?ejkGb=KOR&mallGb=KOR&barcode=9788958811664&orderClick=LAG&Kc= 암의 분자뿐 아니라, 세포 생물학적 기본을 공부하고자 하는 학생들을 위한 『암의 생물학』. 문장을 최대한 정확하게 서술하여 암 생물학의 원리를 설득력 있게 정리하면서 중요한 정보를 풍부하게 담아냈다. 주..

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 연구실에서 야식으로 시켜먹었어요. 종로/혜화/대학로 이쪽에 배달 시켜먹을게 딱히.. 없는 와중에 족발 생각나서 시켜봤습니다. http://map.naver.com/local/siteview.nhn?code=35523859 족발 또는 보쌈 小 19,000원 족발 또는 보쌈 中 21,000원 추천 족발 또는 보쌈 大 24,000원 족발 또는 보쌈 특大 29,000원 족발 더하기 보쌈 스페셜세트 小 30,000원 족발 더하기 보쌈 스페셜세트 中 40,000원 추천 족발 더하기 보쌈 스페셜세트 大 50,000원 족발 더하기 보쌈 스페셜세트 특大 60,000원 불족발 또는 냉채족발 小 19,000원 주문시-쟁반국수,계란찜,계절국물 0원 주..

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 태어나서 블로그에 쓰는 첫 소설 후기입니다. ㅋㅋ 제가 전공책, 혹은 공부할때 빼고는 책을 읽는게 정말 드문데요.. 정신없이 하루만에 다 읽어버린 첫번째 소설입니다. 사실 별 생각 없이 서점에 놀러갔다가 제목이 맘에 들어서 (뮤지컬 지킬&하이드 곡, '지금 이 순간'이.. ㅋㅋ) 아무 생각없이 툭 집고 샀던 책인데요. 정신없이 살아가는 제 삶에 많은 여운을 주는 책입니다. 학업이란 핑계로 가족들에게 겨우 한달에 한번 전화하면 다행인.. 가족 말고도 친구들에게도 제가 먼저 연락하는 경우가 많지 않네요. 1년에 딱 하루만 살 수 있다면, 당신은 어떤 일을 하시겠습니까? 24방위 바람이 지나가고 나면 아무 것도 남지 않으리라. 소설의 ..

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 대학로에 벌써 2년차 거주중.. 지인분들과 저녁먹으러 둘러보던 도중에 모모 스테이크를 들렸습니다. 여긴 고급 레스토랑 같은 곳은 아니구요, 1인 8000~ 13000원 정도의 저렴한 식당이라고 보시면 됩니다! 위치는 여기구요.. 혜화에 괜찮은 식당들이 많지만, 여기도 저렴하고 좋아서 포스팅하려고 사진 몰래 몇장 찍어봤습니다 ㅋㅋ! 혜화역 2번출구 위로 올라오면 뽕신2층에 바로 위치하고 있습니다. 2층이라서 잘 안보이죠.. 저도 엄청 오랜만에 다시 가게됐습니다 ㅋㅋ. 모모스테이크 2층을 올라가면서 보이는 벽화(?) ㅋㅋ 가게 분위기는 이렇습니다. 폰카로 대충 띡띡 찍어서 조명 다번지고 색감도 칙칙하네요.. 메뉴판입니다. 저는 모듬스..

R 프로그래밍에서 이미지 파일을 생성하는 함수는 png, jpeg, pdf.. 기타 등등이 있습니다. > png("test.png") Error in .External2(C_X11, paste("png::", filename, sep = ""), g$width, : unable to start device PNG In addition: Warning message: In png("test.png") : unable to open connection to X11 display. 서버에서 Data visualizing를 할 때, 항상 겪는 에러인데, 매번 찾는것이 귀찮아서 이참에 정리해보려고 합니다. capabilities {base} R Documentation Report Capabilities of t..

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 패키지중에, CRAN repository에서 삭제되는 경우가 종종 있습니다.Package ‘~~’ was removed from the CRAN repository. 이런 경우, install.package() 함수로 설치를 하려고 보면다음과 같은 Warning message와 함께 패키지가 설치되지 않습니다. Warning message: package ‘~~’ is not available (for R version 3.2.1) > 패키지가 사라졌거나, 혹은 인터넷이 안되거나.. 겠습니다. 보통 이런경우 tar.gz 파일로 패키지 파일을 제공하는 곳에서wget으로 파일을 받은 후, CMD 명령어, 혹은 install.packa..

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 특정 R 패키지를 설치하는데, rJava dependency 때문에 설치가 불가능했다. ERROR: configuration failed for package ‘rJava’ * removing ‘/storage/home/sosal/programs/R/R-devel/library/rJava’ 그래서 rJava를 설치하려고 했지만.. > install.packages("rJava") --- Please select a CRAN mirror for use in this session --- CRAN mirror ERROR: configuration failed for package ‘rJava’ * removing ‘/storage/h..

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 다음과 같이 수많은 디렉토리들이 존재한다. 디렉토리 목록만 출력하는 명령어는 매우 간단하다. [sosal@sosal tmpFiles]$ ls -ld */ drwxrwxrwx+ 2 sosal sosal 4096 Dec 17 13:17 0d191d48-caea-47ff-b2a6-aa25db419b48/ drwxrwxrwx+ 2 sosal sosal 4096 Dec 17 13:36 0d894622-7acf-4777-8834-c86f65f093f3/ drwxrwxrwx+ 2 sosal sosal 4096 Dec 17 12:43 0fa20077-608b-4ee5-b00c-343992ecd1d0/ drwxrwxrwx+ 2 sosal sosa..