C#에서 gene expression data 불러오기

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raw data를 읽어와 r=5, d=0.5를 이용하여 filtering 한 이후

textBox1 텍스트박스에 result.Count 결과 출력해주는 프로그램

 

 

private void load_GEO_rawdata()

{

List<string> result = new List<string>();

System.IO.StreamReader sr = new  System.IO.StreamReader(@"C:\Users\bpark\Desktop\Gene_expression.csv");

 

while (sr.Peek() > -1)

{

string[] tokens = sr.ReadLine().Split(new string[] { ",", "8888" },

StringSplitOptions.RemoveEmptyEntries);

double min = 1.0f;

double max = 0.0f;

double r = 5.0f;

double d = 0.5f;

for (int i = 0; i < tokens.Length -1; i++)

{

double v = double.Parse(tokens[i + 1]);

if (v > 0.0f && v <= 1.0f)

{

if (min > v) { min = v; }

if (max < v) { max = v; }

}

}

if ((max / min) > r && (max - min) > d)

result.Add(tokens[0]);

}

textBox1.AppendText(result.Count.ToString());

}