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/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ https://www.biostars.org/p/100123/ 바이오스타를 뒤적이다가 'Separate enrichment analysis of pathways for up- and downregulated genes' 라는 제목의 글을 봤다. Hong, Guini, et al. "Separate enrichment analysis of pathways for up-and downregulated genes." Journal of The Royal Society Interface 11.92 (2014): 20130950. 보통 Gene ontology analysis (혹은 GO analysis)를 할 때, Upregulated ..

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 영어 원서 서적 Bioinformatics은 2004년, 번역된 책 '생물정보학' 은 2003년도 출판된 서적이다. (맨 위의 빨간 책과 원저자가 같은걸로 봐선 다른판본의 번역본인듯) 어릴적부터 책을 가지는걸 그렇게 좋아했는데, 아무튼 약 13년이 지난 책들의 contents를 보니 정말 격세지감이란걸 느낀다. 가지고있는 책의 주요 컨텐츠는 Sequence alignment다. 추가적으로 BLAST, FASTA 같은 Sequence similarity를 평가하는 알고리즘에 대한 내용과 유전자 서열, Structure, Phylogenetic prediction 등의 내용이 있다. 재미있는건 위의 셋 서적 모두, Microarray..

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ Tumor suppressor gene (TSG) 은 말그대로 세포가 종양으로 발전하는걸 막는 유전자다. 암환자 유전체에서 이 유전자에 대한 Loss of Heterozygosity (LOG) 혹은 Loss of function mutation이 일어나는 경우가 많다. 대표적으로 TP53이라는 유전자가 있다. http://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=TP53 Alias 중에, Tumor Suppressor P53이라는 이름이 있을 정도로 대표적인 Tumor suppressor gene중 하나이다. 개인적으로 TCGA의 Colon Adenocarcinoma환자 205명의 somatic..

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 네스카페 NESCAFE - 돌체구스토 (Dolce Gusto) 캡슐커피머신을 얻어왔습니다. 제가 산건 아니고, 친한 친구가 안쓴다며 그냥 공짜로 줬네요. 너무 감사하게 바로 연구실로 들고왔습니다 ㅋㅋ. 이렇게 귀엽고 동그랗게 생겼습니다. 뒤쪽은 사진이 없지만, 수통이 있구요 저 머리 앞쪽 부분에 캡슐을 넣으면 됩니다. 이렇게 캡슐을 딱 넣고 물을 내리면, 캡슐안에 있던 커피에 물이 통과하면서 커피가 내려옵니다. 커피가루 같은건 전혀 안내려오고, 저기 캡슐안에 든 채로 버려지게 됩니다. 캡슐 안에 그냥 커피 농축액이 들어있을 줄 알았는데, 아니더라구요. 그래서 한번 까봤습니다 ㅋㅋ. 캡슐커피 안에는 이렇게 커피가루가 흩날리지 않도록..

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/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 대부분 약물의 작용은 세포 수준에서 설명되지만, 그 효과는 기관 또는 기관계에서 관찰할 수 있다. 따라서 약물 작용을 정확하게 이해하기 위해서는 세포수준에서 약물과의 반응에서부터, 기관 및 기관계에 미치는 효과까지의 과정을 연결시켜 생각할 수 있어야 한다. 베타 차단제(Beta-blockers) 중, Metoprolol라는 약물을 예로 들면 다음과 같다. Metoprolol is a cardioselective β1-adrenergic blocking agent used for acute myocardial infarction (MI), heart failure, angina pectoris and mild to moderate ..

Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE) - to conduct a detailed genetic and pharmacologic characterization of a large panel of human cancer models to develop integrated computational analyses that link distinct pharmacologic vulnerabilities to genomic patterns and to translate cell line integrative genomics into cancer patient stratification. The CCLE provides public access to genomic data, analysi..

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 혜화역에서 '예술인파견지원 만남의 광장' 주제로 행사를 하고있었습니다. 줄타기 퍼포먼스 하시는 분도 계시고.. 미술, 음악 뭐 다양한 예술인 분들이, '예술인 등록' ? 같은걸로 뭔가 커뮤니티를 이루는 모습이었습니다. 자세히는 못봤지만.. 성의없이 사진 대충 찍고 올려봅니다. 줄타기 하시는분.. 관람하시는 분들이 굉장히 많았는데 사진에는 뭔가 허전해 보이네요.. 마로니에 공원 무대쪽에 만남의 광자아 행사준비를 하는 모습이 보입니다. 날씨도 좋아서 공원 바닥에 앉아도 될텐데, 의자도 많이 가져다놨네요 무대 말고 공원 전경에는 이렇게 파라솔을 깔아놓고 뭔가 상담? 이랑 이야기 할 수 있도록 장소를 마련해놨네요. 수염이 길거나.. 헤어..

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 교촌 치킨중에 가장 추천하는 메뉴- 허니오리지널 (허니오리지날) 야들야들, 부들부들, 달콤달콤 대박임. 전화번호는 지도에 나와있습니다. 연구실에서 밤새면서 치킨한마리 뚝딱은 예의 아니겠습니까?냄새날까봐 환기도 시켜주고.. 얼른 치킨포장을 까봅니다. 부들부들..교촌치킨중에는 허니오리지널이 제일 맛있는것 같습니다. 사진이 약간 흔들렸네요.. 허니 소스가 발려져있어서 좀 달달합니다.혼자 다먹기엔 느끼할수도.. 저는 우걱우걱 억지로 다먹었습니다. 교촌 허니오리지널 후기 - ★★★★☆교촌치킨 메뉴중에선 Best인듯 싶습니다.

Genomics of Drug Sensitivity in Cancer The Genomics of Drug Sensitivity in Cancer project is an academic research program to identify molecular features of cancers that predict response to anti-cancer drugs. Figure 1. 3 Main datas Please be aware that our website and results are part of an ongoing project. These webpages are updated frequently and our results are not final or complete. 1. Compou..