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/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 카플란메이어 생존 분포는 샘플에서 사망이 발생함에 따라 누적되는 형태의 계단형태 생존곡선을 나타낸다. 생존분석에서의 반응변수 (종속변수)는 결국 해당 시간에 생존률이 얼마가 되는지를 나타낸다. 1. Kaplan meier 기본 함수 및 사용방법 - survival 패키지 다운로드 - 환자의 생존상태 식별하기 (surv 함수) - 시간에 따른 생존커브 구하기 (survfit) - Cumulative hazard 그래프 그리기 - 다중 생존곡선 그리기 2. 공개데이터 colon을 이용한 kaplan meier 생존분석 - colon 전체데이터의 생존곡선 구하기 - 성별에 따른 다중 생존곡선 구하기 - rx 치료법에 따른 다중 생존곡선..

Burrow-wheeler Transform (BWT) mississippi라는 문자열을 Burrow-wheeler Transform으로 변형시키는 과정은 다음과 같다. 1. 문자열 끝에 #을 추가시킨 후, n by n 테이블을 만든다. (n은 #을 포함한 문자열 길이) 2. 1칸씩 rotate 시킨다. rotate 시키는 방향은 우측이든 좌측이든 관계 없다. 모든 경우의수가 나오도록만 하면 된다. 이 matrix를 Conceptual matrix 𝑀𝑇 라고 한다. 3. roate 시킨 문자열들을 정렬한다. (정렬하는 과정에서 같아지기 때문에 rotate 방향은 상관이 없다.) 정렬된 각 서열의 우측에있는 문자들이 BWT의 결과 sequence이다. 따라서 mississippi#라는 문자열의 B-W tr..

DATABASE * Relational database란 무엇인가? 관계형 데이터베이스는 row와 column의 table 형태로 데이터를 저장하는 관계형 데이터 모델이다. 하나의 데이터베이스는 여러개의 테이블을 가진다. 테이블의의 column은 instance의 attribute의 나열이며, row는 실제 개체의 instance 정보를 담고있다. row는 고유한 unique key를 가질 수 있고, foreign key로서 다른 테이블과 연결될 수 있다. 관계형 데이터베이스는 데이터 시스템을 관리하고 질의하는데 Structured Query Language(SQL)를 사용한다. * Cursor: SQL은 data set을 return한다. 이 모든 데이터 셋을 처리하는것은 불가능하기 때문에, curso..