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/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ http://snpeff.sourceforge.net/ Cingolani, Pablo, et al. "A program for annotating and predicting the effects of single nucleotide polymorphisms, SnpEff: SNPs in the genome of Drosophila melanogaster strain w1118; iso-2; iso-3." Fly 6.2 (2012): 80-92. variant의 position, allele 정보를 주면 얼마나 위험한지 HIGH / MODERATE / LOW 3가지로 분류해줍니다. (그 외 MODIFIER) A high impact..

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ Microarray로 분석을 하고있었다. chip type: HuGene-2_0-st로 작업을 하고 있기에, Affymetrix Power Tool (APT)를 사용하기 위해서는 cdf파일이 input으로 들어가는 상황이었다. - Affymetrix library 파일을 받을 수 있는곳 http://www.affymetrix.com/support/technical/byproduct.affx?product=hugene-1_0-st-v1 그러나 library 파일을 아무리 다운받아봐도 cdf파일이 없었다. bgp, cif, clf, grc, mps, pgf, ps, qcc, smd.. 뭐 이런파일들은 있는데.. 나와 비슷한 사람들이 ..

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ Schwaederlé, Maria, et al. "VEGF-A Expression Correlates with TP53 Mutations in Non–Small Cell Lung Cancer: Implications for Antiangiogenesis Therapy." Cancer research 75.7 (2015): 1187-1190. INTRODUCTION Bevacizumab은 항암제로서 종양에 있어서 많이 사용되는 약물이며 Vascular endothelial growth factor-A (VEGF-A)을 대상으로 한다. Carboplatin, paclitaxel과 결합된 치료법은 실제로 화학요법만 사용했을 때의 생존인..

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 요즘 짬내서 Microsoft student partner 프로그램에서 활동하고 있습니다. Evangelist라고.. 뭐 직역하자면 전도사? .. 마냥 마이크로소프트의 기술들을 홍보하는.. 뭐 서포터즈 개념으로 보면 되겠네요 ㅎㅎ 다양한 기술들을 회사에서 학생들에게 알려주고, 그 기술을 습득하고 그걸 또 다양한 사람들에게 전달하는 역할이라고 보시면 되겠습니다. http://microsoftstudents.com/ 이렇게 도메인도 사고.. 가지고있는 조그마난 서버에 웹사이트도 올려보고 ^^ 팀원들의 실명이 있어서 불안하긴 하지만.. 뭐 개인정보는 없으니 올려봅니다 ㅋㅋ. 혹시 검색타고 들어오면 혼날것 같기도 하네요.. 아무렴, 대학..

다시 물질이 하고싶어져서.. 가볍게 귀여운 느낌의 20큐브로 세팅을 해봤다. 이전에는 2자, 1자, 30큐브 이렇게 해봤었는데 큐브는 작아야 제맛인듯 하다. 30큐브는 귀엽지도 않은게.. 차라리 2자로 가던가 20큐브정도가 딱 적당한 것 같다. 집이 관악구에 있어서 그린피쉬 매장에 가서 직접 구매했다. 사실 그린피쉬가 좀 비싼편이긴 하지만, 배송비내고 인터넷으로 보고 사느니 직접보고 사고싶은거 사는게 더 나을것 같아서 그린피쉬에 직접 찾아갔다. (모 사이트에서는 그린피쉬는 사진보는 사이트라고도...) 개인적으로 좋아하는 가게다 ㅋㅋ 집도 근처라.. 가끔 놀러간다. 20큐브는 LEGLASS 큐브 200으로 구매. 사실 크리스탈이니 뭐니 싼거도 비싼거도 다양한 제품 있는데 나는 별 차이 못느끼겠다.. 그냥 ..

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ library(limma) library(gcrma) > ReadAffy() Error: The affy package is not designed for this array type. Please use either the oligo or xps package. Cell file 배열 type이 기존의 ReadAffy() 함수로 읽어지는 형태가 아닌가보다. array type에 대해 찾아보려면 찾아볼 수 있지만 귀찮아서 에러에서 말한대로 oligo 패키지를 이용해서 CEL 파일을 읽어들이기로 했다. Bioconductor로 쉽게 설치하면 끝난다. > source("http://bioconductor.org/biocLite.R")..

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 빨간 우체통 콘서트라는 행사를 보고 라파 뮤직 (Rapha music) 이라는 엔터테인먼트 회사를 알게됐어요. Link - http://rapham.net 축가라던지 어떤 행사에 부르는 초청가수들은 대부분 알바하는 실용음악과 학생들이라 전혀 기대가 안됐는데, 이 단체에는 정말 뮤지컬, 성악, 클레식, 국악 등의 실력파분들만 있으시더라구요. 위 그림같이 정말 다양한 아티스트 분들이 있다는걸 홈페이지에서 확인하실 수 있습니다. CONTACT 메뉴에 들어가면 라파 뮤직 공연 신청을 할 수 있어요! 결혼식 축가, 호텔 행사 초청공연, 성악가 및 뮤지컬배우 초청공연 등 다양한 주제로 라파 뮤직 공연 신청서를 낼 수 있어요. 고등학교 축제,..

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 파이썬에서 file.readline() 함수 에러가 났다. Traceback (most recent call last): File "/mnt/fhgfs/sosal/TCGA/Source/bin/get_integrate_somatics_onlyone.py", line 28, in line = PR_file.readline() File "/storage/home/sosal/anaconda3/lib/python3.4/encodings/ascii.py", line 26, in decode return codecs.ascii_decode(input, self.errors)[0] UnicodeDecodeError: 'ascii' codec c..

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 윈도우 성능평가 보는 방법은 일반적인 컴퓨터의 경우에 다음과 같습니다. 1. 내컴퓨터 (시작키 + E) -> 내 pc 우클릭 -> 속성 2. 시스템 탭에 있는 성능 표시.. 그런데 없죠 ㅠㅠ 위의 성능평가를 설치하는 방법은 다음과 같습니다. Shift 를 누른 상태로 Install.cmd 우클릭 -> 관리자 권한으로 실행(A) 그럼 끝이에요! ^^ 이렇게 점수를 보실 수 있습니다. 차후에 볼때는 제어판에 성능 정보 및 도구를 확인하시면 됩니다.

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 윈도우 10 업데이트 과정에서 오른쪽 트레이 아이콘이 뜨지 않아서 문제가 있었습니다. http://prolite.tistory.com/595 여기서 win10fix_full.bat 을 이용하여 따라해보니 KB3035583 업데이트가 필요하다고 에러가 뜨네요. 업데이트 목록에도 안뜨고.. 해결책은 아래의 링크를 다운받으시면 됩니다. 윈도우 7 사용자 (windows 7 sp1) http://download.windowsupdate.com/d/msdownload/update/software/updt/2015/05/windows6.1-kb3035583-x64_d6308e28c41fcbd15695343d83709ed1c4bf5812.ms..