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Sosal~ 799

TCGA Somatic mutation

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ Cancer와 관련된 공개서열 데이터에서 가장 유명한 TCGA (The Cancer Genome Atlas)에서는 Somatic mutation data를 특정한 포맷으로 제공한다. - LINK https://wiki.nci.nih.gov/display/TCGA/Mutation+Annotation+Format MAF (Mutation Annotation Format) 파일로서 제공된다. TCGA data portal에서 직접 검색하여 받을 수 있지만, MAF 파일은 https://wiki.nci.nih.gov/display/TCGA/TCGA+MAF+Files 에서 매우 쉽게 파일의 정보들과 데이터 파일의 링크를 찾아볼 수 있다. ..

암의 생물학 - The biology of CANCER

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 암의 생물학 - The biology of CANCER Robert A. Weinberg 컴퓨터공학 전공자로서, 생물정보학(Bioinformatics)를 전공하면서 생물에 관한 부족한 부분들을 채워줄 수 있는 좋은 책이었습니다. http://www.kyobobook.co.kr/product/detailViewKor.laf?ejkGb=KOR&mallGb=KOR&barcode=9788958811664&orderClick=LAG&Kc= 암의 분자뿐 아니라, 세포 생물학적 기본을 공부하고자 하는 학생들을 위한 『암의 생물학』. 문장을 최대한 정확하게 서술하여 암 생물학의 원리를 설득력 있게 정리하면서 중요한 정보를 풍부하게 담아냈다. 주..

Stigmatized./Essay 2015.12.26

종로 혜화 족발/보쌈 배달 - 돈가네왕족발보쌈

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 연구실에서 야식으로 시켜먹었어요. 종로/혜화/대학로 이쪽에 배달 시켜먹을게 딱히.. 없는 와중에 족발 생각나서 시켜봤습니다. http://map.naver.com/local/siteview.nhn?code=35523859 족발 또는 보쌈 小 19,000원 족발 또는 보쌈 中 21,000원 추천 족발 또는 보쌈 大 24,000원 족발 또는 보쌈 특大 29,000원 족발 더하기 보쌈 스페셜세트 小 30,000원 족발 더하기 보쌈 스페셜세트 中 40,000원 추천 족발 더하기 보쌈 스페셜세트 大 50,000원 족발 더하기 보쌈 스페셜세트 특大 60,000원 불족발 또는 냉채족발 小 19,000원 주문시-쟁반국수,계란찜,계절국물 0원 주..

Stigmatized./ETC. 2015.12.26

장편소설 - 지금 이 순간 [판타지 심리스릴러]

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 태어나서 블로그에 쓰는 첫 소설 후기입니다. ㅋㅋ 제가 전공책, 혹은 공부할때 빼고는 책을 읽는게 정말 드문데요.. 정신없이 하루만에 다 읽어버린 첫번째 소설입니다. 사실 별 생각 없이 서점에 놀러갔다가 제목이 맘에 들어서 (뮤지컬 지킬&하이드 곡, '지금 이 순간'이.. ㅋㅋ) 아무 생각없이 툭 집고 샀던 책인데요. 정신없이 살아가는 제 삶에 많은 여운을 주는 책입니다. 학업이란 핑계로 가족들에게 겨우 한달에 한번 전화하면 다행인.. 가족 말고도 친구들에게도 제가 먼저 연락하는 경우가 많지 않네요. 1년에 딱 하루만 살 수 있다면, 당신은 어떤 일을 하시겠습니까? 24방위 바람이 지나가고 나면 아무 것도 남지 않으리라. 소설의 ..

Stigmatized./Essay 2015.12.26

혜화 대학로 저렴한 맛집 [모모 스테이크]

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 대학로에 벌써 2년차 거주중.. 지인분들과 저녁먹으러 둘러보던 도중에 모모 스테이크를 들렸습니다. 여긴 고급 레스토랑 같은 곳은 아니구요, 1인 8000~ 13000원 정도의 저렴한 식당이라고 보시면 됩니다! 위치는 여기구요.. 혜화에 괜찮은 식당들이 많지만, 여기도 저렴하고 좋아서 포스팅하려고 사진 몰래 몇장 찍어봤습니다 ㅋㅋ! 혜화역 2번출구 위로 올라오면 뽕신2층에 바로 위치하고 있습니다. 2층이라서 잘 안보이죠.. 저도 엄청 오랜만에 다시 가게됐습니다 ㅋㅋ. 모모스테이크 2층을 올라가면서 보이는 벽화(?) ㅋㅋ 가게 분위기는 이렇습니다. 폰카로 대충 띡띡 찍어서 조명 다번지고 색감도 칙칙하네요.. 메뉴판입니다. 저는 모듬스..

Stigmatized./Essay 2015.12.24

R - unable to open connection to X11 display.

R 프로그래밍에서 이미지 파일을 생성하는 함수는 png, jpeg, pdf.. 기타 등등이 있습니다. > png("test.png") Error in .External2(C_X11, paste("png::", filename, sep = ""), g$width, : unable to start device PNG In addition: Warning message: In png("test.png") : unable to open connection to X11 display. 서버에서 Data visualizing를 할 때, 항상 겪는 에러인데, 매번 찾는것이 귀찮아서 이참에 정리해보려고 합니다. capabilities {base} R Documentation Report Capabilities of t..

R - Linux에서 tar.gz 파일로부터 패키지 설치하기

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 패키지중에, CRAN repository에서 삭제되는 경우가 종종 있습니다.Package ‘~~’ was removed from the CRAN repository. 이런 경우, install.package() 함수로 설치를 하려고 보면다음과 같은 Warning message와 함께 패키지가 설치되지 않습니다. Warning message: package ‘~~’ is not available (for R version 3.2.1) > 패키지가 사라졌거나, 혹은 인터넷이 안되거나.. 겠습니다. 보통 이런경우 tar.gz 파일로 패키지 파일을 제공하는 곳에서wget으로 파일을 받은 후, CMD 명령어, 혹은 install.packa..

R - rJava 설치 에러날 때

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 특정 R 패키지를 설치하는데, rJava dependency 때문에 설치가 불가능했다. ERROR: configuration failed for package ‘rJava’ * removing ‘/storage/home/sosal/programs/R/R-devel/library/rJava’ 그래서 rJava를 설치하려고 했지만.. > install.packages("rJava") --- Please select a CRAN mirror for use in this session --- CRAN mirror ERROR: configuration failed for package ‘rJava’ * removing ‘/storage/h..

Linux - 여러 디렉토리에 있는 파일 한번에 처리하기

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 다음과 같이 수많은 디렉토리들이 존재한다. 디렉토리 목록만 출력하는 명령어는 매우 간단하다. [sosal@sosal tmpFiles]$ ls -ld */ drwxrwxrwx+ 2 sosal sosal 4096 Dec 17 13:17 0d191d48-caea-47ff-b2a6-aa25db419b48/ drwxrwxrwx+ 2 sosal sosal 4096 Dec 17 13:36 0d894622-7acf-4777-8834-c86f65f093f3/ drwxrwxrwx+ 2 sosal sosal 4096 Dec 17 12:43 0fa20077-608b-4ee5-b00c-343992ecd1d0/ drwxrwxrwx+ 2 sosal sosa..

Linux/Linux_technic 2015.12.18

최강 무료 문서편집기 Notepad++

/* * http://sosal.kr/ * made by so_Sal */ 울트라 에디트 (Ultra edit), 에디트 플러스 (Edit plus) 등등 다양한 윈도우용 문서편집기가 있지만, 대부분 유료에 크랙버젼 쓰기도 좀 그렇고.. 또 대충 무료 편집기를 쓰자니 기능도 별로 없고, 하이라이트 기능 등 코딩 혹은 문서작업 하기에 너무 불편하죠. 무료 편집기중 최강 프로그램인 Notepad++를 추천해드립니다. Link - https://notepad-plus-plus.org/ 위에 보시는 그림과 같이, 자기가 원하는 스타일의 배경, 글자 색으로 스타일 설정도 가능하고 엄청 많은 언어의 highlight도 지원합니다. 다른 유료 문서편집기와 비교해도 전혀 손색 없습니다. 이렇게 굉장히 다양한 언어도 제..

Stigmatized./ETC. 2015.12.16
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