The Cancer Imaging Archive 이미지 받기

Radiology image를 TCIA에서 항상 다운받는데, 항상 그때마다 token이 만료돼서 매번 찾아보게된다.

 

또 까먹고 당황하다가, 이번엔 꼭 정리해서 다음에 또 시간을 낭비하지 않기 위해 기록하기로 함.

 

 

1. TCIA 데이터를 찾아, .TCIA 파일을 다운받는다.

 

예를 들면 CBIS-DDSM 같은.. Mammography 이미지 데이터셋

https://www.cancerimagingarchive.net/collection/cbis-ddsm/

근데 다운로드를 누르면 진짜 이미지를 바로 받는건 아니고, .tcia 포맷의 파일이 다운받아진다.

예를 들면 이렇게: CBIS-DDSM-All-doiJNLP-zzWs5zfZ.tcia

 

 

2. NBIA Data Retriever 를 설치한다.

https://wiki.cancerimagingarchive.net/display/NBIA/8.1+Downloading+the+NBIA+Data+Retriever

나는 리눅스에 다운받는 환경이지만, 윈도우 유저의 경우 여기서 윈도우를 쓰면 됨.

 

아래의 경로로 설치됨

/opt/nbia-data-retriever/nbia-data-retriever

 

 

3. 계정을 생성한다. ID, PW를 기억한다.

https://www.cancerimagingarchive.net/pwm/public/NewUser

이상하게 login, ID 생성 페이지가 잘 안보이는데, 위 페이지로 접속하면 됨.

 

4. crential.txt 파일을 생성한다. 내용은 아래와 같이:

userName=아이디
passWord=패스워드

 

5. 리눅스 커맨드에서 다음을 실행한다.

 

nbia-data-retriever \

    --cli TCIA파일

    -d 다운로드장소

    -l credential.txt

 

ex: 

/opt/nbia-data-retriever/nbia-data-retriever --cli /path/CBIS-DDSM-All-doiJNLP-zzWs5zfZ.tcia -d /mnt/e/CancerImagingArchive/CBIS_DDSM -l /mnt/e/CancerImagingArchive/credential.txt -v –f

 

잘 다운받아지는중 ㅎㅎ

 

 

다운받아진 결과파일