SlicerJupyter 설치 및 실행하기 Tutorial

Command line 서버에서 SlicerJupyter를 설치하려다 낭패를 봤다.

(알고보니 GUI 없이는 거의 불가능한 수준의 난이도였음)

 

이 패키지가 필요한 것이, 어차피 이미지 전처리만을 위한거라서

그냥 후딱 랩탑에서 전처리만 돌려놓고 서버로 옮기려고,

labtop에서 설치해봤다.

 

이게 알면 엄청 쉬운데, 이게 사람이 삽질을 계속 하게만든다...

Install & Run Instruction이 진짜 허접하게 되어있다.

(그냥 한줄로 실행하면 됨~ 수준)

 

혹시라도 이걸 활용하시는 한국인이 계신다면..

저 처럼 몇시간을 낭비하지 않으셨으면 해서 간단하게 리뷰를 남겨봅니다.

 

 

https://github.com/Slicer/SlicerJupyter

GitHub - Slicer/SlicerJupyter: Extension for 3D Slicer that allows the application to be used from Jupyter notebook

 

 

 

 

 

1. Slicer 설치

https://download.slicer.org/

Download 3D Slicer

윈도우 버전으로 설치하고 실행합니다.

 

 

 

2. Slicer 내에서 JupyterSlicer 설치

 

3D Slicer 실행 후

View -> Extensions Manager 실행

 

 

 

3. JupyterKernel 실행

돋보기를 누르고 JupyterKernel 검색

 

그럼 아래와 같이 Jupyter kernel을 실행할 수 있는 버튼들이 생긴다.

위에 Notebook directory를 셋팅하고, Start Jupyter server 버튼 클릭하면 실행이 됩니다.

 

 

4. Slicer kernel로 Jupyter notebook 실행

 

 

 

 

5. 애증의 slicer 모듈 활용 체크

 

잘 된다..

애증의 slicer