Programing/Python programming

python DICOM (DCM) 이미지를 png, jpg로 바꾸기

sosal 2017. 10. 1. 04:51
반응형



DICOM 이미지를 이용해서 학습을 하려고, jpg나 png format으로 바꾸려고 했는데,

예전에 어떤 library를 썼는지 잘 기억이 안나서.. 구글링해보니


mritopng 라는 정말 간단한 패키지가 있어서, 혹시 까먹을까봐 포스팅으로 남겨본다.


https://github.com/danishm/mritopng


위 github에서 zip 파일 다운받아서 압축을 풀고,

콘솔에서 python setup.py install 하나로 설치 완료.




혹은 pip install mritopng


convert_file이란 함수로 파일 이름 하나하나 짚어가면서 바꿀 수 있고,

convert_folder 함수로 폴더 안에있는 모든 dicom 파일을 (DCM) png로 바꿀 수 있다.






import mritopng


# Convert a since file

mritopng.convert_file('/home/user/DICOM/SCAN1', '/home/user/output.png')


# Convert a whole folder recursively

mritopng.convert_folder('/home/user/DICOM/', '/home/user/PNG/')







##########
https://github.com/FNNDSC/med2image

이것도 좋음